Pamuk, selülozik bir elyaftır ve doğası gereği hidrofiliktir. Pamuk, doğrudan, reaktif, vat, indigo ve kükürt boyaları gibi birçok boyaya karşı bir yakınlığa sahiptir. Boya seçimi, son kullanımların çok önemli olduğu beceri gerektiren bir işlemdir.

Bahsedilen tüm boyaların belirli haslık özellikleri ve boyama avantajları vardır. En yaygın reaktif boyalar, tatmin edici haslık özellikleri (pamuktaki hidroksil grubuyla kovalent bağlanma), renklerin parlaklığı, uygulama kolaylığı ve ekonomik olması nedeniyle pamuklu giysileri boyamak için kullanılır.

İndigo boyaları, denim çeşitlerini üretmek ve çeşitli yıkama efektleri elde etmek için iplik boyamada kullanılır.

Direkt boyalar daha ucuz kıyafetlerde kullanılır.

Pamuk, viskon, bambu, keten gibi kumaşlarla birlikte boyanabilir.